Formatear 2DS con pokemon luna preinstalado

Buenas, he comprado de segunda mano una 2DS, la edición azul que tiene el pokemon luna, y tiene la cuenta de Nintendo del anterior dueño. Quiero formatearla para poder poner la mía, ya que anteriormente tuve una 3DS y compré programas que quiero volver a tener, pero he leído que si hago eso, se pierde el Pokémon luna, es así? Y si no, hay algo que pueda hacer para poner mi cuenta y no perder el juego?