Tranquilo, no es un bug. Es una situación clásica de The Legend of Zelda: A Link to the Past (Super Nintendo) que suele atrapar a muchos jugadores en las mazmorras del Mundo Oscuro debido al uso del Espejo Mágico.
En el Palacio de los Pantanos (el segundo templo del Mundo Oscuro), el agua sube y baja, y el uso del espejo altera las posiciones de las puertas y los estados de las salas.
Qué está pasando y cómo solucionarlo:
El estado del cofre y la puerta:
Al usar el espejo dentro de la mazmorra para volver a la entrada, saliste al Mundo Luminoso. Al volver a entrar al templo (o cruzar de nuevo el portal), el juego recuerda que el cofre grande de esa zona ya fue abierto, lo que provoca que la puerta que abriste con su llave aparezca cerrada de nuevo si las condiciones de la sala o el nivel del agua han cambiado.
El camino correcto para avanzar:
Revisa el nivel del agua: En este templo, tienes que manipular las palancas para inundar o vaciar secciones específicas. Si usaste el espejo, es muy probable que hayas reiniciado o alterado el flujo del agua en esa planta o que necesites reingresar por un acceso alternativo desde el exterior (en el Mundo Luminoso) para volver a caer en la sala correcta desde arriba.
Usa el Espejo Mágico desde la ubicación correcta: Sal al patio exterior en el Mundo Oscuro (donde están las zonas inundadas) y párate exactamente en el punto donde, si usas el espejo, aparezcas en una plataforma elevada inaccesible en el Mundo Luminoso. Al hacer esto, al volver al Mundo Oscuro caerás por un atajo que te sitúa más allá de esa puerta cerrada, permitiéndote continuar sin tener que reabrirla.
¿En qué planta exacta estás ahora mismo o qué objetos ves en tu pantalla (llaves pequeñas que te queden, nivel del agua visible)? Dime eso y te indico el paso exacto para retomar el hilo.