La verdad es que tu teoría es muy sólida y podría acabar siendo así, que el Link de Breath of The Wild sea el mismísimo Héroe del Tiempo 100 años después de ser derrotado. De hecho yo creo que tu teoría cobra más fuerza si asumimos que Link murió en su combate final contra Ganondorf, pues la cámara donde Link despierta en BotW se llama “Resurrection Chamber” (Cámara de Resurrección), por lo que es posible que Link sí muriera frente a Ganondorf y los sheikah finalmente fueran capaces de resucitarlo con su tecnología, aunque para ello fueran necesarios 100 años. Esto también reforzaría la teoría que puse hace tiempo que decía que la Meseta es Hyrule Castle Town destruido y desplazado al sur, pues analizando el mapa debería estar donde el castillo y Calamity Ganon están ahora. Tu teoría explicaría que Hyrule Castle Town y el Templo del Tiempo, junto con la cámara de resurreción, fueran desplazados lejos para Link, durante los 100 años que llevaría resucitarlo, estuviera lejos y a salvo de Calamity Ganon. Además, para mí uno de los puntos flojos de la cronología oficial es que los sabios fueran capaces de sellar a Ganon en Sacred Realm (Reino Sagrado) sin la ayuda de Link, con tu teoría, los sabios necesitarían que Link derrotara en combate a Ganon y entonces ellos lo sellarían en Sacred Realm, Ganon lo corrompería, lo que daría inicio a ALttP.

Lo que desencajaría en tu teoría es que en la meseta puedes recoger sal de roca que en su descripción pone que es procedente del antiguo Gran Mar, lo que insinuaría que iría después de The Wind Waker. Igualmente tampoco me explico por qué está Hyrule Castle junto a Calamity Ganon si Ganondorf lo destruyó y construyó su castillo. Pero por todo lo demás encaja perfectamente.

acidmark muy acertada la tuya

Y la del declive se está llevando cada vez más puntos, al menos para mi. Respecto a la teoria acidmark, es posible que tras sellar a Ganon al final de OoT, los sabios metieran en a Link en un trance para despertarlo cuando fuera necesario (como quien mete al congelador las sobras de la cena XD. Estos sabios/sheikah son muy desconsiderados) Sin embargo, Link despierta en la Shrine of Resurrection, lo cual suena más bien a que murió. Como tu bien dices, nunca se dice que Link muera al enfrentarse a Ganon, tan solo fue derrotado. Ese detalle me lleva a pensar que efectivamente no murió. Pero como nadie vive 100 años, Link pudo morir por causas naturales y ser resucitado para la Guerra del Encarcelamiento. El resto de la teoría tiene sentido y es una posibilidad interesante.

Supuestamente si congelas tu cuerpo y tu mente,no puedes envejecer…
Los Kologs y las sales marinas son grandes contradicciones…
Estoy jugando en este momento, The Wind Waker HD.
He encontrado muuchas similitudes y referencias a Ocarina of time, por ejemplo la isla del dragon, la mazmorra es claramente la montaña dodongo (y la musica es la misma), Yabú es como un… Jabu Jabu envejecido…
Pueden hacer que Breath of the wild tenga la misma relacion con otro juego (en este momento estan luchando A link to the past/Between worlds o The Wind Waker/Spirit Tracks)

ocurre después del último de todos

Cronológicamente hay tres últimos, uno por cada línea temporal. Creo que tras ver estos vídeos es bastante probable que tenga lugar después de Zelda II, el último Zelda de su línea temporal, aunque también podría tener lugar antes de A Link to the Past, quién sabe.