Para hacer transferencia y que no se te borre el juego de la memoria, debéis poner No cuando te solicita formatear la SD antes de la transferencia. Tan simple como eso.
Sea como fuere, si por accidente lo eliminas, luego puedes descargarlo de la eshop porque se te ha asociado a tu ID.
Ahora… como hayas encendido la consola, le hayas puesto un ID y, luego pretendas transferir datos de otra consola que tiene otro ID, ahí si que la has liado…